Når en militærkonvoi blir bombet på broen i New Orleans dukker Pride ned i en farlig undercoveroperasjon for å finne en stjålen missil og hindre et angrep på et amerikansk marineskip.
Teamet utreder mordet på en blogger som var dedikert til å avsløre korrupsjon i regjeringen. De oppdager en Navy Seal og CIA-humanitæraksjon med en mørk hemmelighet.
Når en pilot dør i en flystyrt med et kampfly som nylig var godkjent for militæroppdrag, må teamet finne ut om det er en menneskelig svikt som ligger bak.
NCIS-teamet undersøker et mord i marinen, og spør seg hvorfor den drepte piloten brukte en uregistrert drone til å innhente informasjon.
Spesialagent Pride får hjelp fra Australias enhet for militæretterforskning.
Teamet skal være med i det årlige Red Dress-veldedighetsløpet, men må trekke seg da en av deres egne blir funnet død.
Livet til en verdifull marineoffiser henger i en tynn tråd når hjertet han skulle få transplantert blir stjålet.
Spesialagentene Pride og Sonja blir utsatt for et bakholdsangrep i Texas når de eskorterer hovedvitnet i en rettssak mot en beryktet våpenselger.
Forloveden til Prides venninne blir drept under et strømbrudd som rammer hele byen. Pride lover å finne morderen.
Mordet på en marinesoldat gir nye ledetråder i den første saken Pride og Lasalle jobbet på sammen før orkanen Katrina kom og ødela alle bevis. Teamet feirer også Høsthakkefesten sammen i Prides bar.
Bevismaterialet fra en rekke fatale innbrudd fører teamet til Wades adopterte sønn. Sonja blir ertet av LaSalle og Brody.
Sebastian reiser til D.C. for å hjelpe Abby Sciuto med bevismaterialet i saken der broren hennes er involvert, mens Ellie Bishop ankommer New Orleans for å levere en pakke og hjelpe Pride og teamet.
Teamet undersøker mordet på en politibetjent med innvandrerbakgrunn som ble forsøkt iscenesatt som selvmord. Samtidig jobber teamet i all hemmelighet med en onlinedating-profil for Pride.
Spesialagent Pride åpner dørene til baren sin for allmennheten og inviterer til fest, men feiringen får en brå slutt når både han og borgermesteren blir kidnappet.
Når en ukjent fremmed redder en løytnants liv for deretter å forsvinne fra stedet, får teamet en ny sak å jobbe med når det rettsmedisinske materialet tilsier at mannen er en savnet Afghanistan-soldat.
Etter å ha sporet opp stjålet sprengstoff i et produksjonslokale for kokain, avdekker teamet en narkotikabande som produserer sin egen kokain, ledet av Sonjas barndomsvenn, Marion Watkins.
NCIS-teamet beskytter en lokal dj fra en truende person, og de undersøker mordet på en marinekaptein som ble angrepet mens han var på direkten i et radioprogram.
Spesialagent Brody tror at tilfellet der en matros ble påkjørt av en festbuss i det franske kvarter, er knyttet til hennes søsters død. Hun og teamet oppdager likheter mellom de to hendelsene.
Teamet oppdager en varebil full av overvåkingsutstyr og fotodokumentasjon av alle bevegelsene til agent Pride, kartlagt etter at datteren hans ble overfalt på universitetet og gitt beskyttelse.
NCIS-teamet undersøker drapet på en marineløytnant som deltok i et tradisjonelt begravelsesfølge der lokale jazzmusikere ærer de døde med en musikalsk parade.
Når en marineløytnant dør etter et hemmelig besøk hos en general, blir spesialagent Pride og NCIS-teamet bedt om å avvike fra normal prosedyre i løpet av drapsetterforskningen.
En matspesialist besøker familiens 100 år gamle restaurant i det franske kvarteret, og blir utsatt for en eksplosjon.
NCIS-teamet samarbeider med Homeland Security etter at mordet på en marinesoldat sees i sammenheng med etterretningsinformasjon om et mulig angrep på byen.
NCIS-teamet avslører en muldvarp og et katastrofalt angrep på systemsikkerheten når de samarbeider med Homeland Security for å finne nesten et halvt tonn med sprengstoff som er på avveie.