NCIS-teamet samarbeider med flere føderale enheter for å få tak i en snikskytter. FBI-agent Tammy Gregorio ankommer for å etterforske Pride og teamet hans.
Pride får ytterligere motbør fra FBI da han hjelper tidligere etterretningsanalytiker, Elvis Bertrand, som er hovedmistenkt i en drapssak.
Når en dekorert kvartermester blir funnet død inne på et idrettsanlegg, gjør bevisene Pride og NCIS-teamet oppmerksomme på en bortføringssak, der en kvartermester sist ble sett i Mexico.
Sebastian blir bortført etter å ha spist lunsj med moren sin, og blir tvunget til å bruke spilleferdighetene sine i forbindelse med et rømningsforsøk i et fengsel.
Pride og teamet undersøker et flyhavari i et sumpområde, mens LaSalle og Percy intervjuer mulige erstatninger for Brody.
NCIS-teamet ser nærmere på uortodokse treningsøvelser da en Navy Seal-kandidat blir funnet drept bare uker før han skal uteksamineres.
Teamet etterforsker drapet på en menig under et motorsykkelløp. LaSalle spør Gregorio om råd når det gjelder privatlivet.
Pride tar midlertidig vare på en ni år gammel gutt som er den eneste vitne til drapet på sin tante, et medlem av den amerikanske marinen Band.
Det er mistanker om slett spill når en marinekorporal som kjører racerbil har en fatal kollisjon på banen.
Pride får i oppdrag å ta seg av en familievenn som er forlovet med den hovedmistenkte i den pågående kartellsaken.
Sebastian går undercover og Patton tar i bruk sine gamle spilleferdigheter. Pride og teamet gir seg ut på et farlig oppdrag for å fange Garcia.
Pride reiser til en oljeplatform under etterforskningen av et drap. Teamet oppdager en gasslekkasje som er på nippet til å forårsake en katastrofal eksplosjon.
Når tusenvis av sikkerhetsstemplede dokumenter blir stjålet, setter NCIS-teamet i gang en jakt på en undergrunssgruppe av hackere som blir sponset av Prides gamle kontakt, Elvis Bertrand.
NCIS-agentene McGee og Torres drar til New Orleans for å forene krefter med Pride og teamet hans i jakten på en savnet etterretningsmanual i terrorhåndtering.
Et grusomt copycat-drap på en trikk fører til gjenåpning av en sak for Wade, noe som bringer frem vonde minner fra fortiden.
Statsadvokat og Prides venn, Rita Devereaux, ber NCIS etterforske forsvinningen av en krigsadvokat som har spesialisert seg på saker som er hemmeligstemplet.
Teamet legger ut på en byomfattende jakt, etter at en marinejeger går løs på seks mann i en bar.
Tammys eksmann, som tidligere underslo 80 millioner dollar fra nødhjelpstilskudd i kjølvannet av Katrina, kommer i søkelyset igjen - mistenkt for drap.
En dødelig ulykke på en marinebase slipper ut et supervirus som setter både New Orleans og basen for smittefare.
Etter at NCIS oppdager et samarbeid mellom en narkotika-ring og politiet i New Orleans, tvinges Lasalle til å etterforske en tidligere kollega. Pride bekymrer seg for Ritas trygghet.
Mens Pride avlytter borgermester Hamilton, etterforsker NCIS-teamet et togran der hundrevis av marinevåpen ble stjålet.
Drapet på en marinekapellan fører Pride til en mulig forbindelse mellom borgermester Hamilton og illegal aktivitet i Clearwater. Samtidig sliter Percy fortsatt med konsekvensene av en tidligere sak.
En av Hamiltons medsammensvorne åpner ild på en overfylt gate da han ser at Pride følger etter ham.
NCIS-teamet søker hjelp hos FBI og Isler for å avdekke og stoppe den ondskapsfulle planen til borgermester Hamilton.