I det Team Scorpion er i ferd med å slå til mot hackerne som kontrollerer luftvåpenet, får de vite at USAs atomdrevne ubåter også har blitt hacket. Situasjonen er høyst dramatisk, og et rakettvåpen er klart til å bli fyrt av.
Walter blir ved en feiltakelse skutt ut i rommet i en rakett, og fantaserer om Paige i det han er i ferd med å gå tom for oksygen. Team Scorpion jobber febrilsk med å finne en måte å bringe ham tilbake til jorden på før han blir kvelt.
Team Scorpion tar saken når en liten gutt i Ralphs klasse forsvinner. Toby finner ut mer om identiteten til Happys ektemann.
En enkel jobb på Naturhistorisk Museum i Los Angeles blir farlig da Team Scorpion oppdager at noen er i ferd med å rane en edelstensamling, for å skaffe materiale de trenger til å lage en atombombe.
Team Scorpion må ta seg inn i et dypt, enormt hulesystem for å hindre at rotter ødelegger hele Nord-Amerikas økosystem.
Det er valgdag, og Team Scorpion blir tilkalt når noen prøver å gjøre presidentvalget til et eneste stort kaos.
Teamet drar til Irland, og der oppdager Walter at en naturkatastrofe i en innsjø har ført til at det har blitt dannet en giftig sky som kan ta livet av alle i landsbyen.
Paiges mor tilkaller Team Scorpion da hun ved en tilfeldighet oppdager at en glemt atomreaktor er i ferd med å eksplodere.
Walter må svømme gjennom den livsfarlige tjæredammen La Brea for å redde en kvinne som sitter fast i tjæren, før hun går tom for oksygen.
Det er julaften, og Team Scorpion sin elektronikkfrie fjelltur blir livsfarlig da de treffer en bevæpnet bande, og Ralph blir kidnappet når de forsøker å stikke av. Tim tar også en viktig avgjørelse om sin videre fremtid i Team Scorpion.
Cabe blir alvorlig skadet i et oppdrag i ødemarken, og Team Scorpion må kjøle ham kraftig ned for å redde livet hans.
Team Scorpion blir lurt til å produsere falske penger for en fremmed instans som har til hensikt å ødelegge den amerikanske økonomien. Page blir nødt til å stole på at moren hennes sitt talent som svindler, skal redde dem.
Team Scorpion må redde en mann på kanten av en gigantisk sinkgrop som truer med å ødelegge vannforsyningene i Los Angeles for alltid.
Team Scorpions oppdrag med å finne en sunket skatt går galt når båten til Walter og Paige eksploderer midt på Stillehavet.
Walter og Sylvester blir med på en internasjonal sjakk-konkurranse for å redde ut en amerikansk spion før identiteten hennes blir avslørt.
Et oppdrag med å beskytte en frøbank går galt, og Team Scorpion må redde Happy, Sylvester og Cabe som sliter med livstruende hallusinasjoner grunnet frykt.
En storm ødelegger den sterile boblen som Happys venninne Ada bor i, siden immunsystemet hennes er ødelagt. Team Scorpion står overfor en krevende oppgave når de skal flytte Ada til et trygt sted uten å risikere livet hennes.
Teamet må finne en utryddingstruet ape i Amazonas for å finne kuren til et farlig virus fra å spre seg. Toby og Happy drar til en rådgiver for å forberede seg til ekteskap.
Teamet er på oppdrag i en vindmøllepark når de i hui og hast må rykke ut for å redde Paige og Happy før kabelen i gondolbanen de sitter i ryker, og de to styrter i bakken.
Temaet trosser ordrene til en utenlandsk regjering, da de henter inn en asteroide som inneholder DNA med potensielt dødelige konsekvenser, om de blir eksponert.
Teamet forsøker å redde et par forskere som er fanget inne i en kollapset bio-kuppel, designet for Mars.
En tilsynelatende enkel brannslokkingsjobb i en tunnel blir katastrofal, og Team Scorpion hjelper Toby og Happy med å rekke frem til alters for å gi hverandre sitt ja.
På Toby og Happys bryllupsreise, styrter flyet alle er om bord i på en øde øy. Håpet om å bli reddet er minimalt.
Tre uker etter at de krasjlandet på en øde øy, stiger spenningen i Team Scorpion. For å overleve, er de nødt til å bekjempe personlig motsetninger.
Three weeks after they crash land on a deserted island, tensions run high for Team Scorpion when they must battle to overcome their relationship obstacles in order to be rescued.