Oliver må håndtere konsekvensene av eksplosjonen på øya Lian Yu, og han må konfrontere en utfordring uten like.
Oliver prøver så godt han kan å balansere rollene som borgermester, Green Arrow og pappa til William. Samtidig returnerer Anatoly til Star City med en dødelig agenda.
Et brutalt, team ledet av Onyx, bryter seg inn i Kord Industrier. Oliver sliter fremdeles med å finne tonen med William, og ber om hjelp fra uventet hold.
Akkurat når Oliver er i ferd med å få orden på ting, angriper Black Siren nok en gang innbyggerne i Star City.
Slade spør Oliver om hjelp til å finne den kidnappede sønnen sin, men oppdraget blir komplisert med nye avsløringer, og han blir redd han aldri får sett sønnen sin igjen.
Slade fortsetter å avdekke spor om sønnen sin, og Oliver tar en stor avgjørelse når han leder teamet i kampen mot Dragon.
Oliver feirer Thanksgiving med familien, men festen blir forstyrret. Samtidig vender Black Siren tilbake for å spre ødeleggelse i ferien.
Barry og Iris sitt bryllup bringer heltene fra Arrow, Supergirl, The Flash og DC's Legends of Tomorrow sammen. Når kjeltringer fra Earth-X angriper under seremonien, samler superheltene troppene sine for å redde verden.
Quentin Lance er kidnappet av Black Siren og Clayden James, som krever masseødeleggelsesvåpen som betaling for Quentins liv. Oliver og Team Green Arrow må finne en måte å redde Quentins liv uten å risikere at byen blir ødelagt.
Oliver oppdager en av Caydens hemmeligheter, og bestemmer seg for å samarbeide med en usannsynlig fiende for å vinne over ham. Samtidig tilbringer Dina mer tid med Vince.
Cayden setter i gang en terroraksjon mot Sin City, og hacker seg inn på byens internett for å ta kontroll over det elektriske systemet. De to teamene forsøker å stanse ham, samtidig som William får vite at Oliver fremdeles er Green Arrow.
Oliver fortsetter kampen med Cayden James. Samtidig er Dinah og Oliver svært uenige om en avgjørelse som setter livet til en av deres egne i fare.
Cayden James oppdager en hemmelighet om Green Arrow som setter ham under sterkt press. Oliver er smertelig klar over at alle han elsker er i fare, og vurderer å be sine gamle lagkamerater om hjelp.
Thea oppdager at Quentin har holdt Black Siren skjult. Team Arrow rykker dermed ut for å redde henne, og for å finne ut hvor pengene som har forsvunnet befinner seg.
Oliver og Thea blir sjokkerte når de hører at Roy Harper er tilbake i Star City. Når de får nyss om omstendighetene rundt tilbakekomsten, skjønner de at Roy er i trøbbel, og iler til for å redde ham. Samtidig tar Black Siren en drastisk avgjørelse.
Nyssa Al Guhl vender tilbake til Star City or å advare Thea om at en gruppe frafalne fra League of Assassins planlegger et angrep mot henne.
Oliver og Diggle står overfor sin største utfordring noensinne, og Curtis blir skuffet over nyheter hun får om sin nye kjæreste.
Oliver sliter mentalt, og lurer på om han er en fiasko både som far, borgermester og helt. Han lar frustrasjonen gå utover Felicity og William. Et overraskende besøk fra en gammel venn får han til å vurdere fremtiden.
Diaz og Laurel ønsker å utvide imperiet sitt, og har et møte med Quadrant, en samling av mafiafamilier, som driver organisert kriminalitet i hele landet. Samtidig øker Felicity og Curtis innsatsen for å få bygget Helix Dynamics.
Oliver oppsøker en gammel venn for å få hjelp i kampen mot Diaz. Rene har kommet ut fra sykehuset, men sliter med å tilpasse seg sin nye tilværelse og Lance oppdager sjokkerende nyheter om Black Siren.
Presset øker på for Oliver, og han begynner å lure på om han kan komme til å tape alt i kampen for å redde Star City. Samtidig vender et kjent fjes tilbake.
Diaz setter seg som mål å ramme Team Arrow og deres nærmeste. Oliver sliter med at Felicity setter seg selv i fare, da hun får en mulighet til å stanse Diaz for godt.
Med en ny alliert på laget, utfordrer Oliver Diaz til en episk kamp i den siste episoden av seriens sjette sesong.