Etter at et fly styrter, finner sheriffen Jo Evans en ensom jente i nærheten av ulykkesstedet. Jo bestemmer seg for å hjelpe jenta og tar henne med hjem til familien sin.
Mens Jo fortsetter å lete etter svar, dukker en mystisk mann opp i byen. Piper prøver å forstå sine nye evner, mens hun blir bedre kjent med familien.
Piper blir rammet av en mystisk sykdom. Mens Jo og Benny etterforsker den mektige mogulen Richard Kindred, vurderer Jo å ta imot hjelp fra en ukjent kilde.
Jo begynder at tvivle på, om det var det rigtige valg at tage sig af Piper, efter hun finder ud af mere om hendes fortid.
Jo er fast bestemt på å bevise at Kindred stod bak angrepet på Benny og April. Samtidig begynner Piper å få intense og forvirrende syner.
Jo og Benny etterforsker dødsfallet til Kindreds tidligere forretningspartner. Mia hjelper Piper med å oppdage kreftene sine.
Familien er anspent etter å ha oppdaget Pipers hemmelighet. I mellomtiden sliter Piper med følelsene sine, mens Emily i all hemmelighet utnytter situasjonen.
FBI ankommer Southold og kompliserer Jos forsøk på å finne Emily. I mellomtiden drar Alex og Piper for å finne svar.
Jo og Chris må unngå FBI mens de etterforsker cyberterroristene. Ed får en behandlingsplan for sin kreft som virker for god til å være sann. Samtidig setter en mystisk kvinne Piper og familien i fare.
Familien mottar informasjon som kan lede dem til Piper. Jo og Brooks følger sporet, mens Ed hjelper Mia med å sende en beskjed til Piper. Alex og Chris oppdager en mystisk last i havnen.
Jo og Brooks samler sammen et usannsynlig team i et forsøk på å kommunisere med Piper. Piper prøver på sin side å redde Benny fra Helens mystiske oppdrag.
Jo setter mye på spill for å bekjempe Helen og få Piper i sikkerhet. I mellomtiden prøver Helen å gjenskape Pipers krefter, og Benny prøver å gjenvinne Jos tillit.
Jo og Brooks er i fare. Piper er fast bestemt på å hjelpe og rekrutterer et uventet team av allierte for å finne dem før det er for sent.