Gibbs og McGee reiser til Russland for å eskortere hjem en NCIS-dataingeniør som sitter på hemmelighetsstemplet informasjon. Oppdraget trues når Russiske leiesoldater tar opp kampen.
Når en marineløytnant blir drept på vei til et privat møte med presidenten, får NCIS oppgaven med å finne ut om mordet var del av en tyveribølge i området eller et direkte angrep i forbindelse med besøket.
Når en sak avslører en kobling til Duckys gamle barndomsvenn, reiser han og spesialagent Bishop til London for å intervjue vennes omgangskrets. Ducky reflekterer over valgene han har tatt i livet.
En av marinens vitenskapsmenn myrdes og marineministeren ber NCIS-teamet samarbeide med spesialstyrken for terrorisme. Den hovedmistenkte viser seg å være ettersøkt av den russiske regjeringen.
Under en fellesøvelse for kystvakten og NCIS oppdager Gibbs og agent Boris en død mann i sjøen. Mannen er savnet fra et skip 60 nautiske mil unna, et skip som viser seg å være kapret av pirater.
Når kona til en marineoffiser myrdes må teamet ta stilling til om mordet er linket til hennes yrke som terapeut, eller om det er en terrorhandling når mannens navn blir funnet på en Jihad-dødsliste.
Under en mordetterforskning avslører teamet en bedragersk veldedig organisasjon. Bishop plages av resultatene etter prøvetidsevalueringen sin, mens Tony vurderer å adoptere en villkatt.
Mens teamet etterforsker en dødspåkjørsel hvor sjåføren har stukket av, forsøker Gibbs å renvaske en av deres ansatte som er anklaget for å ha gitt ulovlig legehjelp da hun forsøkte å redde ofret.
I påvente av bedre vær på Dulles flyplass, bruker DiNozzo, Bishop og ektemannen Jack tiden på å undersøke en terrortrussel mot en rekke flyplasser i den travle thanksgivinghelgen.
NCIS-teamet snakker med tre internett-terrorister som de fengslet etter at internett var nede i hele byen uken før jul. McGee reflekterer over saken og Gibbs beryktede regler i et brev til faren.
Teamet etterforsker en rekke åsteder hvor det ser ut som om den skyldige har kopiert tidligere saker. To av Gibbs ekskoner dukker opp på et åsted for å diskutere noe viktig med ham.
Gibbs og teamet jobber sammen med FBI-agent Fornell i jakten på en amerikanskfødt terrorist som har blitt sporet til Syria, men som nå skal være tilbake på amerikansk jord rundt D.C.
En marineløytnant som er troppens første åpent homofile tjenestemedlem blir funnet myrdet. Når termindatoen nærmer seg for Palmers kone sørger han for et baby shower på NCIS-basen.
DiNozzo returnerer til militærakademiet han gikk på som tenåring, når en marineoffiser som gikk på samme skole blir funnet drept med bildet av en nåværende elev i hånden.
Gibbs erkefiende er mistenkt for å være ansvarlig for en eksplosjon under et toppmøte om global terror, men Gibb velger ikke å ta del i etterforskningen for å støtte en sørgende Fornell isteden.
Teamet etterforsker et mord hvor offeret gikk under et alias fra Gibbs fortid. Bishop blir nervøs av tanken på å jobbe som spaner i fremtiden, og teamet oppdager Gibbs datanerdhemmelighet.
Med sin ekspertise om det svarte markedet, hjelper DiNozzo senior teamet med en mordetterforskning hvor uvanlige malerier har blitt stjålet og byttet ut med en falsk kopi.
McGee gjenforenes med kjæresten Delilah for å etterforske dødsfallet til en tyv som ble funnet død i huset til en marineoffiser. Delilah og forsvarsdepartementet får en ny ledetråd til en terrorgruppe.
Mordet på en underoffiser gir et spor i en førti år gammel sak om en bombe på en flyplass. McGee blir sur.
DiNozzo får kjæresten sin, Zoe Keates, som partner, fordi det er en sammenheng mellom sakene de jobber med.
Mordet på en marineoffiser fører Gibbs og Bishop til Afghanistan hvor en terrorgruppe holder en annen marineoffiser fanget. DiNozzo blir irritert over de nye rekrutteringsbrosjyrene.
Spesialagent Ned Dorneget fra NCIS-avdelingen for cyberoperasjoner assisterer teamet når en marineoffiser blir myrdet. Teamet finner ut at Jake og Gibbs har blitt gode venner.
En enkel hackeretterforskning utvikler seg til et globalt samarbeid når beviser avduker at en internasjonal terrorgruppe, som også rekrutterer barn på internett, kjøper bomber på det svarte markedet.
Et dødelig bombeangrep resulterte i et tungt og overraskende tap for teamet. En global terroristgruppe, som også er kjent for å rekruttere ungdom på nett, havner i søkelyset.