Gibbs och Fornell försöker spåra ledaren för det nätverk som sålde droger till Fornells dotter. Samtidigt måste teamet hantera ett ärende med ett försvunnet lik från NCIS obduktionsrum.
Flashbacks avslöjar mordutredningen som ursprungligen introducerade den unga Gibbs till NCIS och början på relationen med en ung Ducky som just hade kommit till USA.
Upptäckten av två döda kroppar leder teamet in i en värld av modern skattjakt. Under tiden går Gibbs och Fornell djupare och djupare in i sitt sökande efter ledaren för ett gäng droglangare.
McGee och hans fru Delilahs semester på Bahamas förvandlas till ett viktigt uppdrag när en båt som är inblandad i ett NCIS-mordfall anländer till ön.
Gibbs och Fornells jakt på ledaren för en knarkliga som bär ansvaret för Fornells dotter Emilys överdos når sitt klimax.
Efter ett tips om smugglade vapen, hamnar Bishop och Torres i skottlossning i en gammal sheriffbostad som nu är en historisk plats, för att sedan också bli inlåsta i de övergivna fängelsecellerna.
NCIS utreder mordet på en marinofficer som dödades när han körde hem en nyligen utsläppt fånge. Gibbs försöker hjälpa Palmer att hantera trauma.
Efter att Sloanes namn upptäcks i en övergiven buss i Afghanistan så följer Gibbs med henne på en resa för att hitta en grupp flickor som kidnappades från bussen. En hacker skickar e-postmeddelanden som avslöjar information till talibanerna.