En dag han kjører hjem fra skolen finner Stuart en skadet fugl. Det viser seg at hun heter Margalo. Med redd og skjelvende stemme forteller hun Stuart at hun er på rømmen fra Falken, en fryktet fugl som elsker å terrorisere alle skapninger i Manhattan. Det viser seg at Margalo er hjemløs, og når Stuart oppdager det insisterer han på at hun flytter inn hos familien Little . Men lykken er kortvarig, for det tar ikke lang tid før Margalo forsvinner på mystisk vis...