Jason Bourne dukker opp igjen, og denne gangen har han ett eneste mål: å gå tilbake til begynnelsen for å finne ut hvem han er. Et møte med en engelsk reporter vekker en rekke nye minner til live hos Bourne, og han er klar til å konfrontere Organisasjonen en gang for alle. Men først må han utmanøvrere de som jakter på ham.