Den tidligere CIA-agenten, Erica Shepherd, er den mest beryktede forræderen i moderne historie. Hun hentes ut av føderalt fengsel for å stoppe en av de farligste spionene som truer USA i dag.
Da en tidligere CIA-agent blir myrdet, ber Keaton Shepherd om hjelp til å gjenopprette verdifull informasjon som kan felle Tal en gang for alle. Men er Shepherd til å stole på?
De oppdager at en amerikansk ambassadør selger klassifisert informasjon til et colombiansk kartell, så Shepherd legger en plan for å fange han. Men planen hennes tvinger Keaton til å tøye sine moralske grenser.
Når informasjonen Sheperd skaffet i ADMAX fengslet blir koblet til et nært forestående angrep på amerikansk jord, begir Keaton og teamet seg ut på en menneskejakt for å stoppe den dødelige agenten.
Shepherd klarer å overbevise Keaton om at Anna Cruz er en muldvarp som faktisk jobber for Tal, så Keaton og teamet begynner å spionere på Anna i håp om at hun vil lede dem til Tal.
En bombe eksploderer i Jersey City, og teamet anholder nøkkelpersonen Sam Fathi. Men de klarer ikke å få noen informasjon, og det haster å få stoppet en ny bombe fra å gå av.
FBI får tak i stjålet NSA-programvare som er beregnet for Tal, så Keaton øyner en mulighet til å gå på offensiven, og sender Shepherd for å overlevere teknologien til den tiltenkte mottakeren.
I tilbakeblikk avsløres de skjebnesvangre hendelsene som førte til at Erica Shepherd forrådte sitt land, og den påfølgende etterforskningen som gjorde at hun røk uklar med med Will Keaton.
Etter at en viktig Tal-agent unnslipper CIAs varetekt, returnerer Shepherd til Langley for å spore opp rømlingen. Shepherd og Keaton oppdager at CIA tilbakeholder viktig informasjon om Tal.
Da en gruppe entreprenører som jobber for CIA blir drept ombord i flyet sitt, oppdager Keaton og hans team at det finnes hemmeligheter som CIA holder skjult for FBI når det gjelder Tal.
Keaton og teamet må gå undercover når en svært sofistikert Tal-agent klarer å kommer seg unna FBI og flykter til den sveitsiske ambassaden. Det som startet som en smidig operasjon utvikler seg rakst til en intens gisselsituasjon.
Keaton og teamet får avgjørende informasjon fra en Tal-kontakt i fangenskap. Denne informasjonen gir dem muligheten til å gripe inn og stoppe drapet på en høyprofilert kongresskvinne.
Erica Shepherd overbeviser Will Keaton om å la henne reise til Cuba for å forhindre Tal's angrep på Sierra Maestra, CIAs hemmelige fengsel.