Wolverine reiser til dagens Japan og havner på dypt vann når han møter sin ultimate nemesis i en kamp på liv og død som vil forandre ham for alltid. For første gang er han sårbar og presset til sin ytterste fysiske og emosjonelle grense, og han må ikke bare konfrontere dødelig samuraistål men også den indre kampen mot sin egen dødelighet. Vil han komme ut på andre siden enda sterkere enn vi noen gang har sett ham?