Brennan er bortført av sin tidligere assistent, Zack Addy, og Booth og resten av teamet leter desperat etter henne.
Teamet etterforsker om en robot med kunstig intelligens var programmert til å drepe sin skaper, mens Bones planlegger en overraskelse til bursdagen sin.
Teamet får bryne seg på eldrehjemsdramatikk da liket av en gammel mann blir funnet ved en syrefylling. På laboratoriet, dominerer diskusjon om ekteskap og barn.
Aubreys far dukker opp igjen og utgjør et moralsk dilemma for ham. Drapet på noen fra Booth og Brennans fortid blir etterforsket.
Når en studentveileder blir funnet død, etterforsker teamet alle mulige gjerningsmenn - inkludert en romkamerat med et rulleblad.
Booth og Brennan etterforsker det lemlestede liket til en tømmerhogger. Etterforskningen kommer med flere avsløringer, inkludert en affære med en gift rival.
Booth må grave i fortiden, når lik med en forbindelse til hans tidligere militærenhet begynner å dukke opp i Washington D.C. Brennan er bekymret for faren sin.
Et nytt tap skaper splid mellom Booth og Brennan da de begge, hver for seg, forsøker å takle sorgen deres. Samtidig besøker en gammel flamme Brennan.
Booth, Brennan og Aubrey jobber i sivilt på et billøp, for å etterforske en forferdelig ulykke. Dr. Gordon Wyatt kommer tilbake for å hjelpe Hodgins og Cam når Gormogon-saken står i stampe.
Når det brennende liket til en manusforfatter faller ned på en passerende bil, etterforsker teamet en rekke innspillingssteder og karakterer knyttet til filmen hans.
Booth gjør det han kan for å beskytte seg selv og sine nærmeste da Kovac rømmer og setter sin farligste plan noensinne ut i livet. Brennan vitner samtidig for Zach.
Teamet leter etter bevis som kan føre dem til Kovac, uten Brennan, og må ta i bruk alt hun har lært dem i jakten.